[Ivanhoe]

Переименовывать есть смысл, если вы четко понимаете весь объем работ с этим связанный. Если никто из пользователей стандартный хелп не читает, стандартные тренинги и книги - тоже, вы поменяете термины на всех метках, которые могут встретится, посчитали стоимость этой переделки и бизнес ее принимает, то почему бы и не поменять?
Но в целом идея такая, что есть система и она "так работает" - проще обучить, обычно.

Ну а отличия уже выше написали.
Отгрузочная - вокруг комплектации, оригинально "picking list", т.е. лист подбора.
Отборочная - это отпуск со склада (или "Акт приемки" / "Приходный ордер" на закупке или даже "Поступление продуктов" в 2012), в оригинале "Packing Slip", то бишь упаковочный лист, который сопровождает груз, отгруженный со склада.