Ключевые особенности этих случаев - использование функциональных гранул/модулей, которые в одной системе дороже, чем другие.
Вообще, сравнение имеет смысл только под конкретную ситуацию. А то можно далеко досравниваться - например вот
здесь ты делаешь вывод о том, что нет принципиальной разницы между ценами на axapta и 1С.
Мысль детальнее я уже раскрывал - я считаю, что система без модификаций внедряется быстрее/дешевле и поддерживается легче/дешевле, нежели сильно модифицированное решение. Что же касается способов снижения стоимости внедрения - они замечательно отражены на твоем же сайте, как раз там, где идет речь о пресловутых 2 месяцах на внедрение.