В чем проблема выгрузки?
1. Выгружаете все необходимые данные,
2. потом средствами ЕКСЕЛЬ заменяете информацию в данных (функция ВПР).
3. И заливаете обратно в CRM.
Цитата:
Поле номер уникальное и однозначно определяет компанию
Этого CRM не умеет, но умеет Excel