таможенный журнал - локальная функциональность в РФ, в рамках которой проводится оформление ГТД и расчет пошлин. в RU5 появилась, если не ошибаюсь. много тем на форуме, поищите.
А где в Аксапте он находится? Наверное, у нас не накатывались эти обновления, не могу найти в интерфейсе.